Zweck der Elise-Averdieck-Stiftung ist es, das diakonische Profil zu stärken. Die Stiftung fördert Projekte des Gesamtwerkes Diakonissen-Mutterhaus Rotenburg.
Aktuelle Projekte sind der Hilfsfonds für in Not geratene Mitarbeiter, die kunsttherapeutische Betreuung der Patienten der onkologischen Tagesklinik, die soziale Begleitung der Patienten in der Notaufnahme und die Förderung des Sozialfonds der Evangelischen Fachschulen für Sozialpädagogik.