Mitarbeit in Fachgesellschaften
In der Deutschen Gesellschaft für Pneumologie ist Professor Schaberg Mitglied des wissenschaftlichen Beirates.
Seit 2006 ist Professor Schaberg Herausgeber der medizinischen Fachzeitschrift PNEUMOLOGIE, dem Organ der Deutschen Gesellschaft für Pneumologie und Beatmungsmedizin.
Seit 2004 ist Professor Schaberg Geschäftsführer der Norddeutschen Gesellschaft für Pneumologie.
Weitere aktive Mitgliedschaften betreffen die American Thoracic Society (ATS), die International Union Against Tuberculosis and Lung Diseases (IUATLD) , die Paul Ehrlich-Gesellschaft (PEG), die Deutsche Gesellschaft für Innere Medizin (DGIM), die Deutsche Lungenstiftung, die Gesellschaft für Fortschritte in der Medizin, das American College of Chest Physicians (ACCP), die Deutsche Gesellschaft für Infektiologie (DGI) sowie den Arbeitskreis „Hygiene“ der Arbeitsgemeinschaft wissenschaftlicher medizinischer Fachgesellschaften.
Professor Schaberg ist Mitherausgeber der Zeitschrift „Respiration“, einer in der Schweiz erscheinenden internationalen pneumologischen Fachzeitschrift.

Berufungen
2005 und 2007 wurde Prof. Schaberg vom Präsidenten des Robert-Koch-Institut in den wissenschaftlichen Beirat der „Arbeitsgemeinschaft Influenza“ berufen.
2006 erfolgte die Berufung in den „Pandemie-Rat“ durch die Bundesministerin für Gesundheit.